大三巴牌坊上各种雕像栩栩如生，既保留传统，更有创新;既展现了欧陆建筑风格，又继承了东方文化传统，体现着中西文化结合的特色，堪称”立体的圣经”。
大三巴牌坊视为一座不朽的祭台。牌坊分为上下四层，顶部为三角楣。就整体而言，牌坊表达着两组意义：一组由下两层的方形构成，主要反映耶稣会宗徒及传教士的工作，属于周游地球传教的现世教会一派；另一组是由上层的三角形构成，主要表现至圣圣三（圣父、耶稣基督、圣神）与在天主面前为人类代褥的童贞玛利亚。 从下往上看，在底层大门上方刻有耶稣会（IHS）祭记和学院名称（天主圣母），第二层立有四位耶稣会圣人全身塑像，第三层正中为无原罪玛利亚升天，两边由身着白袍的修士之石刻围绕，极富东方特色。第四层正中为天父之子耶稣雕像，两旁刻着其救赎苦难的象征。牌坊顶部十字架下的三角形，象征着天父的召唤，正中有一幅鸽子形状的铜像，传说代表圣神，四周环绕的太阳月亮星辰象征圣母童贞怀孕时的刹那时光牌坊高约27米，宽23.5米，为意大利文艺复兴时期”巴洛克”(畸形珍珠barroco)式建筑物，共分五层，底下两层为同等的长方矩形，由三至五层构成三角金字塔形。顶端竖有”十”字架，其下嵌有象征圣灵的铜鸽;铜鸽像的旁边围着太阳、月亮及星辰的石刻，象征圣母童贞怀孕一刹那时光;铜鸽之下为一圣婴雕像，其左上是”永恒之火”的雕像，右侧则是”生命之树”的石刻;第三层的正中刻着一个童贞圣母像，旁边以牡丹和菊花环绕，前者代表中国，后者代表日本;雕像左方还刻有”永恒之众”。一艘”葡式帆船”及一个”面目狰狞的魔鬼”;第四层分别供奉耶稣四名圣徒的雕像;第三层与第四层的左右两侧，雕刻有中华民族传统文化艺术的象征动物-狮子;底层为三面门户，正门的楣额上用葡文刻着”MATERDEL”意即”天主圣母”，两侧的门上刻有耶稣的记号”IHS”。
此教堂糅合了欧洲文艺复兴时期与东方建筑的风格，体现出东西艺术的交融，雕刻精细，巍峨壮观。经历三次大火的圣母，以庄严而悲悯的目光，在温和的阳光下，安详地注视着喧闹的人群，感受着岁月从脚下流过。真正的智者，寡言神思，将一切都付诸时光的流逝；而牌坊下，流连于阶梯和广场的鸽子们，像是神的信使，在熙熙攘攘的人群中闲庭信步，感受世俗的真实和温暖。
