文|陈根
尽管癌症的诊断和治疗已经取得了一定程度的进步，但在很多国家，癌症仍然是导致儿童死亡的一大元凶。由于儿童时期癌症发病年龄和肿瘤生物学特性不一致，使得不同儿童期癌症具有病理学和临床表现上的异质性。
然而，个性化儿童癌症的治疗面临着挑战，仅45％的儿童癌症与成人癌症有着相同的驱动基因，因此儿童癌症需要新的治疗药物。此外，儿童癌症通常是由结构性变异驱动的（SVs），这些变异难以识别和靶向。
在精准医疗的指导下，新的靶向疗法和免疫疗法发挥出巨大的潜力。依据肿瘤分子特征的变化来制定个性化疗法，可以更有效地控制癌症，并减少治疗带来的副作用。
近日，来自圣裘德儿童研究医院的研究人员利用较为全面的测序方法，对309例儿童癌症患者做了全基因组测序（WGS）、全外显子测序（WES）、RNA-seq研究，发现86%的患者都携带与诊断（53%）、预后（57%）、治疗（25%），以及癌症易感性（18%）相关的变异。
通过对比肿瘤细胞与生殖细胞系WGS和WES的数据，研究人员发现在单核苷酸变异（SNV）和插入删除变异（indels）中有41%变异频率低于0.2，15%低于0.1。这表明使用该测序方法能发现许多致病或可能致病（P/LP）的变异。
此外，研究团队利用WGS数据寻找SVs，在90例患者中发现了34组不同的驱动基因融合，其中有30组是有着明确或者潜在的诊断、预后、治疗应用价值的，有23组是不同癌症的诊断信号。
接着，研究人员利用来自FDA的治疗靶点数据，以及其他的基于NGS的研究成果和专业的指南，发现在253例患者中有218例（86%）都至少携带一个与诊断、预后、治疗，以及癌症易感性相关的变异。
在G4K研究中，有78例患者患有复发或转移性癌症，而且并没有合适的临床试验可供他们参与。但其中的12例患者在接受了与他们的肿瘤突变特征相匹配的靶向药治疗后，有5例出现了缓解。这表明全面的基因组和转录组分析促进了儿童癌症的精准医疗。
该研究结合利用了WGS、WES、RNA-seq三种不同的测序数据，全面描述了儿童癌症的基因组特征。未来可靶向药物治疗肿瘤变异，为儿童癌症精准治疗提供道路。
